원천세 신고 늦으면? 수정신고 기한·방법부터 가산세까지 알아보기

2025-12-23

원천세 신고는 소득 종류가 다양하고, 매월 반복적으로 챙겨야 하는 업무이기 때문에 인사 담당자에게 부담이 큰 업무 중 하나입니다. 특히 신고나 납부가 하루라도 늦어지면 가산세가 ‘일 단위’로 계속 늘어나기 때문에, 한 번 실수하면 생각보다 큰 비용으로 이어질 수 있는데요.

이번 글에서는 원천세 신고를 잘못 신고하거나 적게 신고했을 때 어떻게 수정신고를 해야 하는지, 가산세는 언제부터 어떤 기준으로 계산되는지, 그리고 인사 담당자들이 실무에서 자주 헷갈리는 FAQ까지 한 번에 정리해보았습니다.

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▪︎ 원천세 가산세, 언제 내고 어떻게 계산할까?

1. 원천세 개념 및 납부 절차

원천세란 특정 세금의 이름이 아니라 급여나 보수를 지급할 때 회사가 근로자를 대신해 미리 떼어 납부하는 국세 전체를 통칭하는 개념입니다. 여기에는 근로소득, 사업소득, 기타소득 등이 모두 포함됩니다. 회사는 아래 순서에 따라 원천세를 신고·납부해야 합니다.

① 세금을 공제한 금액을 지급

② 매월 원천세를 신고 및 납부

③ 간이지급명세서·지급명세서를 제출

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▸ 근로·사업소득 간이지급명세서 제출부터 가산세까지 자세히 알아보기 >

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2. 원천세 신고·납부 기한

이러한 원천세는 소득 종류별로 세율과 신고 방식은 조금씩 다르지만, 신고 기한은 지급일이 속한 달의 다음 달 10일로 동일합니다. 만약 신고 또는 납부를 제때 하지 못하거나 납부해야 할 금액보다 적게 납부하면, 가산세가 발생합니다.

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3. 원천세 가산세 계산식

원천세 가산세는 아래 계산식에 따라 계산 가능합니다.

(미납세액 × 3%) + (과소·무납부세액 × 0.022% × 경과일수)

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여기에서 헷갈리는 개념은 ‘미납세액’과 ‘과소·무납부 세액’의 차이입니다. 미납세액은 신고는 했지만 기한까지 실제로 내지 않은 세액이고, 과소·무납부세액은 아예 신고를 안했거나, 실제보다 적게 신고한 세액을 의미합니다.

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아래와 같은 예시를 통해 가산세를 계산할 수 있습니다.

예시 1) 신고는 했지만 납부하지 않은 경우

실제 세액: 100만 원
신고 세액: 100만 원
납부 금액: 0원

→ 미납세액: 100만 원, 과소·미납세액: 0원

가산세: 100만 원 × 3% = 3만 원

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예시2) 신고도 덜 하고, 납부도 안 한 경우

실제 세액: 100만 원 (경과 일수: 20일)
신고 세액: 60만 원
납부 금액: 0원

→ 미납세액: 60만 원, 과소·미납세액: 40만 원

가산세: (60만 원 × 3%) + (40만 원 × 0.022% × 20) = 19,760원

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✅ 사용자 Tip: 상시근로자 수가 20명 이하인 사업장이라면 매월 신고 대신 반기 신고를 선택할 수 있습니다. 단, 자동으로 적용되지 않으므로 신청이 필요합니다.

1~6월 지급분 → 7월 10일
7~12월 지급분 → 다음 해 1월 10일

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▪︎ 홈택스 원천세 수정신고 방법

신고 금액을 잘못 입력했거나, 일부 소득을 누락했다면 반드시 ‘수정신고’로 바로잡아야 합니다. 이때 수정신고를 하더라도 이미 납부기한을 넘겼다면 가산세는 부과됩니다.

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홈택스 원천세 신고 페이지에서 원천세를 수정신고하는 방법은 아래와 같습니다.

일반신고 → 수정신고 → 기본정보 입력 → 원천징수이행상황신고서(원청징수세액환급싱청서) 작성 → 제출 및 신고 완료

기본정보 입력 시 ‘귀속 연월, 기본사항, 원천징수 신고 구분, 신고할 소득 종류’ 4가지만 입력하면 나머지 항목은 자동으로 채워집니다.
제출 후, ‘원천징수등 납부지연가산세 계산해보기’ 기능을 활용하면 가산세를 미리 확인할 수 있습니다.

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기한을 넘겨 가산세가 발생하더라도, 아래와 같이 정해진 기한 내 제출할 시 단계적으로 가산세를 감면받을 수 있습니다. 이 기한까지 넘기면 원래대로 가산세를 납부해야 합니다.

신고기한 후 경과 기간	감면율
1개월 이내	90%
1개월 초과 3개월 이내	75%
3개월 초과 6개월 이내	50%
6개월 초과 1년 이내	30%
1년 초과 1년 6개월 이내	20%
1년 6개월 초과 2년 이내	10%