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근로소득 지급명세서, 제출 기한과 가산세·수정신고까지 핵심 정리

2025-01-07

근로소득 지급명세서는 간이지급명세서와 달리, 연말정산 결과가 최종 반영되는 확정 신고 자료입니다. 급여 지급 사실만 정리하면 되는 간이지급명세서와 달리, 과세·비과세 구분부터 4대보험료, 소득공제·세액공제 내역까지 모두 맞아야 해 인사 담당자에게 부담이 될 수 있습니다.

이번 글에서는 근로소득 지급명세서의 제출 기한과 가산세, 수정신고 그리고 실무자가 반드시 확인해야 할 핵심 사항까지 살펴보도록 하겠습니다.

1. 근로소득 지급명세서, 어떤 서류인가요?

근로자에게 급여를 지급했다면, 사업주는 국세청에 그 지급 내역을 담은 근로소득 지급명세서를 매년 국세청에 제출해야 합니다. 국세청은 이 자료를 바탕으로 근로자의 소득과 세금 계산이 정확했는지 확인하고, 연말정산 결과를 최종 확정합니다.

근로소득 지급명세서에 포함되는 주요 항목은 아래와 같습니다.

  • 과세 급여액
  • 비과세 소득 항목(식대, 자가운전보조금 등)
  • 4대보험 근로자 부담분
  • 소득공제·세액공제 내역
  • 원천징수 세액

2. 근로소득 간이지급명세서와 지급명세서의 차이

근로소득 간이지급명세서와 지급명세서의 주요 차이는 아래와 같습니다.

구분 근로소득 간이지급명세서 근로소득 지급명세서
목적 근로장려금 지급 등 복지 행정용 1년간 소득 확정 및 연말정산
제출 주기 매월 연 1회
신고 내용 • 근로자 인적사항
• 지급액·원천징수액
• 근로자 인적사항
• 연간 총급여·세액
연말정산 반영 여부 X O

간이지급명세서는 소득 파악을 위한 중간 정산 참고 개념으로 사용되는 반면, 지급명세서는 연말정산에 직접적으로 사용되는 최종 보고 문서입니다.

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3. 근로소득 지급명세서 제출 기한 및 가산세

근로소득 지급명세서는 소득 지급일이 포함된 해의 다음 해 3월 10일까지 제출해야 합니다. 만일 기한을 넘기면 다음과 같은 가산세가 부과됩니다.

  • 미제출·지연 제출 시: 지급액의 1%
  • 기한 후 3개월 이내 제출 시: 가산세 50% 감면(0.5%)

단, 기한 후 3개월까지 지나면 다시 1%가 적용되므로, 연말정산 일정과 지급명세서 제출 기한을 함께 관리하는 것이 중요합니다.

4. 근로소득 지급명세서, 제출 및 작성법은?

근로소득 지급명세서는 홈택스 페이지(PC) 또는 손택스(모바일)를 통해 제출할 수 있으며, 근로자가 많을 경우 엑셀 파일을 통한 일괄 제출도 가능합니다.

  1. 로그인 후 [지급명세·자료제출·공익법인] → [근로소득 지급명세서 제출] 선택
  2. [과세년월, 제출년월, 원천징수의무자 기본사항] 입력
  3. [상세내역 작성하기]
  4. [과세자료 제출]

5. 근로소득 지급명세서 수정신고 해야 하나요? FAQ 모음

Q. 간이지급명세서를 제출했다면 연말에 근로소득 지급명세서를 안 내도 되나요?

A. 아니요, 근로소득 지급명세서도 반드시 제출해야 합니다.

간이지급명세서는 지급 사실을 중간에 보고하는 자료이고, 근로소득 지급명세서는 연말정산 결과를 확정하는 자료입니다. 두 자료는 서로 대체되지 않습니다.

Q. 연도 중 퇴사해서 퇴직정산까지 끝난 직원에 대해서도 제출해야 하나요?

A. 네, 제출해야 합니다.

퇴사 여부와 관계없이, 해당 연도에 지급한 급여는 근로소득 지급명세서에 포함됩니다. 퇴직금은 퇴직소득 지급명세서로 별도 신고합니다.

Q. 수습 기간에 지급한 급여도 지급명세서에 포함해야 하나요?

A. 네, 포함해야 합니다.

수습 기간 역시 근로관계가 성립된 상태이기 때문에 지급한 급여는 모두 근로소득에 해당합니다.

Q. 12월에 발생한 실적에 대한 상여를 다음해 1월에 지급했습니다. 어느 해에 대한 근로소득 지급명세서에 포함하나요?

A. 실제 지급한 연도 기준으로 포함해야 합니다.

예를 들어 2024년 실적에 대한 상여를 2025년 1월에 지급했다면, 이는 2025년 근로소득 지급명세서에 포함됩니다.

Q. 근로소득 지급명세서를 잘못 제출했으면 경정신고를 해야 하나요?

A. 아니요, 수정신고를 해야 합니다.

지급명세서는 세금 신고처럼 경정신고를 하는 것이 아니라 홈택스에서 수정 제출 방식으로 정정 가능합니다.

  • [신청/제출] → [(근로·사업 등) 지급명세서] → [직접작성제출방식(수정) 또는 변환제출방식] 선택 → [제출하기]

이번 글에서는 근로소득 지급명세서의 제출 기한과 가산세, 수정신고 그리고 실무자가 반드시 확인해야 할 핵심 사항을 살펴보았습니다. 근로소득 지급명세서는 단순한 신고 서류가 아니라, 연말정산과 원천징수 결과를 국세청에 최종 확정하는 자료인 만큼 작은 오류도 그대로 부담으로 이어질 수 있습니다.

따라서 인사 담당자들은 근로소득 지급명세서를 제출하기 전, 급여대장과 연말정산 결과, 원천징수 신고 내역이 서로 일치하는지 확인해 불필요한 가산세와 수정 부담을 예방하시기 바랍니다.

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